213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1600 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1600  drug/metabolite exporter (DME) family protein  100 
 
 		 310 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0255  hypothetical protein  99.35 
 
 		 310 aa  584  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0283  hypothetical protein  83.5 
 
 		 310 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.12 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2716  hypothetical protein  28.76 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  28.62 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  27.36 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  27.94 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  27.94 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  28.09 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  30.07 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  32.29 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  28.31 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  28.31 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  26.18 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  36.17 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  28.31 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  28.31 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.94 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  29.78 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  32.17 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2053  RarD family protein  28.67 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.163977  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  27.78 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  28.24 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  28.82 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  27 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  32.02 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  28.64 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  27.18 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  26.61 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  27.17 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  28.57 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  29.18 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.61 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  25.66 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  30.42 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  27.75 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  26.72 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  31.09 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  27.27 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  28.88 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  32.16 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  25.85 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  27.52 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  29.78 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  32.16 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.38 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  27.85 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  30.77 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  26.49 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  33.03 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  26.62 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  27.14 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  25.98 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  26.16 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  29.66 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  26.58 
 
 		 284 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  26.22 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  27.2 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  29.37 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  25.64 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  27.65 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.06 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  36.71 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  27.85 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  26.96 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  30.29 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  43.66 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.13 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  28.52 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  31.88 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  30.26 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  42.11 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  25.27 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  26.47 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  25.81 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  52.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  23.98 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  31.82 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  28.21 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  24.73 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  19.59 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  37.04 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  21.54 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  26.05 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  28.57 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  25.93 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  29.19 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1342  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.56 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  25.51 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  30.64 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  37.93 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>