213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0283 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0283  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  587  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1600  drug/metabolite exporter (DME) family protein  83.5 
 
 		 310 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0255  hypothetical protein  82.85 
 
 		 310 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.16 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  28.99 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2716  hypothetical protein  29.97 
 
 		 329 aa  99  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  27.15 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  29.88 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  31.33 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  32.48 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  28.8 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  28.09 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  26.85 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  28.09 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  28.52 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  31.09 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  28.33 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  31.8 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  31.3 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  28.46 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  29.6 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  26.32 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  26.41 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  28.9 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  28.7 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  29.52 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  28.84 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.04 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  28.84 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  28.84 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.84 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  25.49 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  25.56 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  29.35 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  27.82 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  31.73 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  28.26 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  27.35 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  29.08 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  25.84 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  40.4 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  30.89 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.58 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  24.88 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  38.18 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  27.2 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  28.25 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  24.79 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.64 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  31.01 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  30.77 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  25.57 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  27.05 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  31.25 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  29.6 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  28.7 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  29.3 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.25 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  27.72 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  26.1 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  27.1 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  25.25 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  38.1 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.17 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  24.82 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  28.82 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  29.41 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  29.18 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  29.95 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  25.91 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  38.33 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  26.29 
 
 		 284 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.53 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  38.33 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  26.64 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  27.04 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  26.34 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  26.78 
 
 		 307 aa  52.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  29.51 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  26.72 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.05 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  25 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  27.14 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  27.9 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  23.53 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  26.72 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  34.25 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  31.36 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  28.85 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>