More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_07041 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  100 
 
 
295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  55.32 
 
 
302 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  58.11 
 
 
304 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  54.96 
 
 
302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  52.46 
 
 
302 aa  311  7.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  55.02 
 
 
302 aa  308  6.999999999999999e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  46.15 
 
 
295 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  49.82 
 
 
296 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  48.04 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  47.33 
 
 
296 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  37.46 
 
 
292 aa  178  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  36.69 
 
 
301 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  38.02 
 
 
291 aa  168  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.78 
 
 
277 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  37.23 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  35.77 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  32.95 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  32.95 
 
 
284 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  31.73 
 
 
281 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  31.73 
 
 
281 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  31.73 
 
 
281 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.86 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  29.01 
 
 
334 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.08 
 
 
283 aa  113  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.31 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  31.03 
 
 
305 aa  112  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  29.89 
 
 
291 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  31.31 
 
 
334 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 
305 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  29.97 
 
 
288 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  29.97 
 
 
288 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  32.74 
 
 
318 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  32.74 
 
 
318 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.43 
 
 
324 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  30.14 
 
 
324 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  30.45 
 
 
311 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 
322 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  31.5 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  30.34 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.57 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  28.36 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.73 
 
 
290 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  32.31 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 
273 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  31.84 
 
 
314 aa  95.9  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  31.37 
 
 
286 aa  95.5  9e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  27.69 
 
 
269 aa  95.5  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  29.35 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  26.89 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  30.42 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  28.18 
 
 
277 aa  93.2  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 
329 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.2 
 
 
297 aa  92.8  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  26.55 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
329 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  29.17 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  28 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  28.21 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  28.08 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  26.42 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  27.74 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  28.23 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  25.45 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  31.71 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  29.01 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.2 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  32.94 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  29.35 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  29.06 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  28.83 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  25.09 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  26.32 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  26.26 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  26.95 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  26.64 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  28.73 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  28.31 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  29.78 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  29.45 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  29.08 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  31.1 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  30 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  23.62 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  30 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  26.64 
 
 
310 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  24.65 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  30.56 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  30.9 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  25.17 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  30.56 
 
 
283 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  26.09 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  28.91 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  27.37 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>