More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1107 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 291 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  40 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  38.46 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  38.46 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  34.75 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  35.49 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  35.15 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  35.56 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  34.86 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  31.86 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  30.14 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  30.31 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  30.61 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  30.5 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  28.85 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  25.82 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  32.14 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  28.25 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  28.25 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  26.57 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  25.53 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  29.55 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 		 277 aa  96.3  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  28.42 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  25.96 
 
 		 331 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  25.24 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  26.97 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  29.44 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  28.36 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  28.51 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  27.5 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  27.17 
 
 		 334 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  24.51 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  27.35 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  24.21 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 333 aa  89  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  25.19 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  25.82 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  28.27 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  25.17 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  25.19 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  25.19 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  27.88 
 
 		 310 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  27.1 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  26.86 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  23.83 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  25.09 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  25.74 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2007  hypothetical protein  25.39 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.21006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  27.27 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.33 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  31.63 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  26.45 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  24.55 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  28.57 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  29.17 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  27.89 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  28.14 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  23.83 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  27.27 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.11 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  27.5 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  25.27 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  25.36 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  27.24 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  27.17 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  23.81 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  28.04 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  25.35 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  28.65 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  25.37 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  23.08 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  25.48 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  27.44 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  25.37 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  29.63 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  25.36 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  23.31 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  27.07 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  21.63 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  23.27 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  23.16 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.07 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.06 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>