More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_15881 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  100 
 
 		 304 aa  600  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  58.11 
 
 		 295 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  51.71 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  51.34 
 
 		 302 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  53.69 
 
 		 302 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  52.29 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  45.61 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  48.36 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  44.75 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  44.41 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  39.34 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  39.93 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  38.41 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  38.66 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.37 
 
 		 277 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  30.55 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  31.87 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  31.91 
 
 		 284 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  31.06 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  28.99 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  28.99 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  28.99 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  30.36 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  35.54 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  30.71 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  30.8 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  28.97 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  28.97 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  28.37 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  32.33 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  32.2 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  29.9 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  31.92 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  28.73 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  28.03 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  32.14 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  31.62 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  29.81 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  31.87 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  29.93 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  32.29 
 
 		 277 aa  99.8  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  32.21 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  31 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  28.72 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.74 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  28.21 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  28.53 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  28.53 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  32.17 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  27.14 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  27.14 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 273 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  27.14 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  30.18 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  30.92 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  30.04 
 
 		 281 aa  89  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  24.12 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.94 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.73 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  28.9 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  25.86 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  26.27 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  28.77 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  32.28 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  27.43 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  27.05 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  27.24 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  29.46 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  25.18 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  27.14 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  29.46 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  29.46 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.96 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  27.44 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  27 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  29.07 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  27.4 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  32.21 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  29.07 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  29.57 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  27.8 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  30.35 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  26.42 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  22.45 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  29.33 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  32.08 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  26.43 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  29.21 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>