More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0125 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  98.32 
 
 		 297 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  42.16 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  41.81 
 
 		 287 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  39.04 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  38.97 
 
 		 288 aa  202  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  38.97 
 
 		 288 aa  202  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  38.14 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.56 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.83 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  32.21 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  30 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  30 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  30 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  32.96 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  31.02 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  28.68 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  26.09 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  32.81 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  30.15 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  33.67 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  27.59 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  26.83 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  27.27 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  35.18 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  25.7 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  24.13 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  29.12 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  27.78 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  27.43 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  28.57 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  32.21 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  26.9 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  26.91 
 
 		 286 aa  89  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  27.27 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  23.63 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.77 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  24.74 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  25.17 
 
 		 331 aa  86.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  25.61 
 
 		 299 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  27.11 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  23.81 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  24.19 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  25.11 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  25.11 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  24.91 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.4 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  27.3 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  28.34 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  24.48 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  26.02 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  22.95 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  24.91 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  27.74 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  24.92 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  26.92 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  22.57 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  26.67 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  22.4 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  27.5 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  24.32 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.94 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  24.09 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  25.62 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  27.03 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  25.09 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  26.26 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  27.14 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.74 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  27.11 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  19.81 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  23.86 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  27.63 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  19.81 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  19.81 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  23.96 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  26.79 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  23.88 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  24.82 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.45 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  24.65 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  23.53 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  25.88 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  24.81 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  24.39 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  25.27 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  26.13 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  24.22 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.07 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  26.17 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>