297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0190 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  585  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  43.9 
 
 		 287 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  43.55 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  40.27 
 
 		 291 aa  216  5e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  40.62 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  40.62 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  38.14 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  38.14 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.82 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.65 
 
 		 283 aa  176  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  32.73 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  32.36 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  33.96 
 
 		 334 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  31.45 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  29.43 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  29.43 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  31.06 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  29.08 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  31.62 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  31.62 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  28.78 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  27.17 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  26.22 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 		 277 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  29.14 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  25 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  25.34 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  27.56 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  31.23 
 
 		 287 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  29.62 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  29.72 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.77 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  25.52 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  25.34 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  26.64 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  28.47 
 
 		 331 aa  89.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  27.12 
 
 		 312 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  26.69 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.76 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  23.94 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 333 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  29.7 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  29.66 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  28.52 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  25.09 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  30.53 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  25.09 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  29.72 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  29.66 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  26.45 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  25.78 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  23.61 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  25.82 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  26.64 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  28.03 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  27.84 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  24.22 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  26.13 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  27.9 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  28.36 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  27.64 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  25.36 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  23.21 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  27.37 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  24.35 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  25.09 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.88 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  29.58 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  23.94 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  23.26 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  25.69 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  24.37 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  24.46 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  25.69 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  20.91 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  25.72 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  25.09 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  25.18 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  28.04 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.09 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  26.01 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  26.69 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  21.84 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  24.41 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  23.13 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  26.38 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  24.48 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  27.76 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  26.91 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>