197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0747 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  541  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  40.57 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  37.5 
 
 
277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  36.62 
 
 
306 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  36.2 
 
 
307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  33.57 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  35.51 
 
 
324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  34.91 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.75 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  35.74 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  35.51 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  33.45 
 
 
295 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.2 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  35.29 
 
 
303 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.61 
 
 
329 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  35.42 
 
 
283 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  34.69 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  31.54 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1567  putative transmembrane protein  33.56 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1497  putative transmembrane protein  34.62 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  36.48 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0952  putative transmembrane protein  32.68 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.493794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1034  putative transmembrane protein  32.68 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0651009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3279  putative transmembrane protein  34.23 
 
 
302 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  30.11 
 
 
295 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  34 
 
 
287 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  32 
 
 
314 aa  99.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  29.08 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  29.54 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  28.26 
 
 
294 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.47 
 
 
312 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  29.93 
 
 
334 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  28.26 
 
 
296 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  29.43 
 
 
296 aa  89  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  28.47 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  30.85 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.47 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  32.97 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  28.78 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.9 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  32.02 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  27.18 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  32.02 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  25.98 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  28.52 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  27.99 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  27.99 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  26.21 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  31.06 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  28.57 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  28.08 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  29.34 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  27.59 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  26.62 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  27.14 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  27.14 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  27.14 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  27.68 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  28.42 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  25.71 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  28.23 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  29.24 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  28.06 
 
 
338 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  25.18 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  27.34 
 
 
338 aa  75.5  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  29.14 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.62 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  29.5 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  27.89 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  30.32 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  29.15 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  28.16 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  29.09 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.69 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  26.92 
 
 
281 aa  72  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 
291 aa  72  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  28.62 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  27.81 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  26.92 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.32 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  26.92 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  27.51 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.53 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  27.8 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  28.88 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  27.24 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  27.7 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  26.55 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  25.99 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  27.08 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  28.57 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  26.56 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  31.69 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  25.46 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>