220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2879 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  100 
 
 		 295 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  61.9 
 
 		 303 aa  362  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1497  putative transmembrane protein  64.36 
 
 		 300 aa  346  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  61.04 
 
 		 305 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1034  putative transmembrane protein  60.13 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0651009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0952  putative transmembrane protein  60.13 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.493794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1567  putative transmembrane protein  57.7 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3279  putative transmembrane protein  58.82 
 
 		 302 aa  311  5.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  50.83 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  46.41 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  46.25 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  47.37 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  44.44 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  47.95 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  43.17 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.16 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.83 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  39.25 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  41.69 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.88 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  37.01 
 
 		 277 aa  165  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  41.67 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  33.45 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  34.19 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  33.47 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  33.06 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  28.07 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  29.12 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  29.12 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  29.12 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.67 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  35.06 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  36.08 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.28 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  24.91 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  28.93 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  29.37 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.62 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  28.57 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  30.56 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  27.43 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  30.03 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  27.65 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  28.62 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  30.21 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  28.15 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  29.25 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  25.09 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  26.81 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  28.67 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  26.81 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  28.67 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  29.18 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  26.55 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  29.81 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  28.52 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  30.5 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  29.68 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.31 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  28.32 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  26.15 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  26.6 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  26.45 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  26.15 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  23.49 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  29.97 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  25.76 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  29.39 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  26.2 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  25.93 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  27.54 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  23.11 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  29.45 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  25.61 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  27.99 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  29.33 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  21.43 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  29.33 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  25.86 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  31.32 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  25.09 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  28.36 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  26.76 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  28.04 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  27.86 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  29.09 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>