More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3467 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  73.7 
 
 
293 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  73.7 
 
 
293 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  73.7 
 
 
293 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  32.74 
 
 
297 aa  142  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  33.45 
 
 
296 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  32.03 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  32.16 
 
 
294 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  36.21 
 
 
287 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  30 
 
 
288 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  32.07 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  33.94 
 
 
298 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  25.93 
 
 
295 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
305 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  26.16 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  27.53 
 
 
331 aa  99.4  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  30 
 
 
277 aa  99  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  26.52 
 
 
317 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  27.76 
 
 
281 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  34.1 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  25.93 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  30.54 
 
 
301 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  29.28 
 
 
295 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  27.62 
 
 
285 aa  93.2  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.41 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  27.57 
 
 
331 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  30.36 
 
 
295 aa  89.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  24.03 
 
 
310 aa  89  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  27.65 
 
 
302 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  28.1 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  34.55 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  29.03 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  30.37 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  30.13 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  28.7 
 
 
292 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  27.08 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.64 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.64 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  27.73 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  26.25 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  25.27 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  26.06 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  27.35 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  27.14 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  31.48 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  26.06 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  29.41 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  27.08 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  29.51 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  27.55 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  26.74 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  25.18 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  24.62 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  27.55 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.72 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  28.52 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  24.7 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  28.52 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  27.05 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  30.39 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  28.97 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  28.62 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  23.93 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  27.19 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  25.66 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  29.41 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  26.48 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  28.57 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  27.73 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  25.26 
 
 
294 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  25.98 
 
 
288 aa  79  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  25.98 
 
 
288 aa  79  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  25.09 
 
 
315 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  27.03 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  28.07 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  29.69 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  28.12 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  29.76 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  25.75 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  28.31 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  28.28 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  27.89 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.6 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.68 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  28.68 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.78 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  26.83 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  24.48 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  30.43 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  26.34 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>