More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4102 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 287 aa  563  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  39.79 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  38.6 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  38.3 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  39.65 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.76 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  34.56 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  35.19 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  34.67 
 
 		 310 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  34.67 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  27.53 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  28.52 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  27.53 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  27.53 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  30.14 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  28.47 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  30.56 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  28.83 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  28.14 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  27.05 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  29.23 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  28.87 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  27.05 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  28.72 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  28.11 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  30.18 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  28.63 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  25.17 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  25.18 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  29.18 
 
 		 284 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 273 aa  95.9  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  26.94 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  28.4 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  27.57 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  28.12 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  28.12 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  28.12 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  27.74 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  28.52 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.08 
 
 		 287 aa  89  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  27.4 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  29.83 
 
 		 307 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  27.43 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  24.66 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  25.09 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  28.67 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  28.67 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  27.65 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  27.01 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  25.78 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  27.27 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  25.77 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  26.13 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  25.95 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  27.4 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  28.72 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  27.55 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  23.47 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  27.92 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  27.92 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  26.35 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  27.76 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  25.86 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  28.38 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  26.64 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.46 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  23.43 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  24.1 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  25.86 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  26.2 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  24.09 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  26.55 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  25.44 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  26.6 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  26.55 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  31.82 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  26.69 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  28.62 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  25.42 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  25.16 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  25.77 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  25.17 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  23.83 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  25.09 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  28.27 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  23.45 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  27.9 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  24.71 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  26.71 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>