More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1722 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 307 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  64.57 
 
 		 303 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  60.75 
 
 		 311 aa  330  1e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  60.41 
 
 		 311 aa  326  3e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  32.99 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  37.23 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  31.21 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  33.44 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  33.99 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  36.33 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  36.33 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  35.32 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  33 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  32.59 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  30.33 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  32.55 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  34.55 
 
 		 310 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.21 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.36 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  34.33 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 		 312 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  33.68 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  31.77 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  34.07 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  33.11 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  34.28 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  34.24 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  34.24 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.52 
 
 		 296 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  31.51 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  31.17 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  31.77 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  31.92 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  31.85 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  33.69 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  31.48 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  33.1 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  33.8 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  34.11 
 
 		 310 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.93 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  33.09 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  31.16 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  29.15 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  34.38 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.07 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  30.86 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.54 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  32.39 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  29.89 
 
 		 294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  30.65 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.63 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  31.43 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  35.54 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  31.49 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  34.8 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  31.15 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  32.26 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  30.37 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.72 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  30.32 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  29.93 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  28.34 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  32.4 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  29.43 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  33.22 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  31.64 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.84 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  31.93 
 
 		 317 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  31.27 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  31.93 
 
 		 317 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  24.91 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  35.5 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  33.86 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  30 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2496  hypothetical protein  32.66 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.580148 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  30.54 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.66 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  38.77 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  33.11 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  29.86 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  28.92 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  28.77 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  29.51 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  31.03 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  30.56 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  28.43 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  32.13 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  29.86 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>