More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2579 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  577  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  97.28 
 
 
296 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  67.48 
 
 
287 aa  323  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  41.01 
 
 
298 aa  178  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  34.07 
 
 
303 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  34.15 
 
 
281 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  33.8 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  33.8 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  33.09 
 
 
287 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
307 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  36.93 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  32.16 
 
 
295 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  34.69 
 
 
284 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  30.08 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  30.08 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  30.08 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  30.14 
 
 
295 aa  125  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  32.59 
 
 
311 aa  125  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  31.32 
 
 
277 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  32.73 
 
 
311 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
297 aa  122  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  34.19 
 
 
284 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.37 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.2 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  29.17 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  28.72 
 
 
312 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.16 
 
 
290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  33.97 
 
 
314 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  31.6 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  31.62 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  31.75 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  32.74 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  31.15 
 
 
318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  31.15 
 
 
318 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  32.8 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  30.55 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  30.55 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  30.8 
 
 
324 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  34.93 
 
 
317 aa  112  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
312 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  34.33 
 
 
313 aa  112  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  27.78 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 
312 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.76 
 
 
305 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  30.03 
 
 
295 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  31.1 
 
 
324 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  27.43 
 
 
297 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  30.58 
 
 
295 aa  106  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  28.98 
 
 
291 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  28.47 
 
 
331 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  31.87 
 
 
281 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  28.62 
 
 
296 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  27.66 
 
 
300 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1567  putative transmembrane protein  31.19 
 
 
305 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  29.96 
 
 
292 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  28.25 
 
 
310 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  27.99 
 
 
296 aa  103  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 
329 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  27.57 
 
 
296 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  30 
 
 
304 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  28.07 
 
 
287 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.67 
 
 
296 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  28.07 
 
 
287 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  30.42 
 
 
292 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  22.54 
 
 
295 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  32.64 
 
 
305 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  28.27 
 
 
310 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  30 
 
 
302 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  29.76 
 
 
333 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  29.62 
 
 
334 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  31.66 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  30.63 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  28.04 
 
 
317 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 
329 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  28.32 
 
 
310 aa  99  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  29.66 
 
 
296 aa  99  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  29.33 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  31.25 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  31.63 
 
 
313 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  32.17 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  29.37 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  28.22 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  28.36 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  30.2 
 
 
295 aa  96.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  31.49 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  25.09 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  27.4 
 
 
292 aa  96.3  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  28.62 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  27.17 
 
 
315 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 
299 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
314 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  29.02 
 
 
292 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  29.02 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  29.52 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  25.09 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  33.61 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  27.05 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  26.04 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>