More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0175 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  38.43 
 
 
291 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  39.7 
 
 
292 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.64 
 
 
314 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  39.33 
 
 
292 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  39.13 
 
 
315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  38.49 
 
 
295 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  36.5 
 
 
310 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.5 
 
 
313 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.19 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  37.91 
 
 
317 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  39.85 
 
 
292 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  36.84 
 
 
347 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  38.11 
 
 
288 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  35.45 
 
 
294 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  38.52 
 
 
317 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  36.53 
 
 
311 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  37.93 
 
 
292 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.15 
 
 
339 aa  148  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  39.62 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  38.49 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  39.62 
 
 
292 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  39.54 
 
 
311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  37.04 
 
 
295 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  37.94 
 
 
317 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  36.96 
 
 
313 aa  139  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.03 
 
 
305 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  32.71 
 
 
285 aa  137  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  36.59 
 
 
317 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  36.59 
 
 
317 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  34.54 
 
 
333 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  33.21 
 
 
309 aa  136  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  35.93 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  36.49 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  35.64 
 
 
317 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  37.23 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  33.09 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  33.22 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  34.91 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  37.5 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  32.18 
 
 
318 aa  132  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  37.5 
 
 
310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  31.87 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  35.66 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.68 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  33.21 
 
 
319 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  32.87 
 
 
324 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  34.73 
 
 
318 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  33.45 
 
 
304 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  38.83 
 
 
288 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  34.35 
 
 
318 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  36.76 
 
 
285 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.21 
 
 
328 aa  122  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  34.29 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  30.8 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  30.82 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  32.06 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  37.73 
 
 
288 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  33.1 
 
 
297 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  34.98 
 
 
321 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  34.22 
 
 
308 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  32.86 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  29.93 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  29.93 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  29.93 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 
305 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  33.22 
 
 
317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.2 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  32.59 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  34.3 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  33.46 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.27 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  35.36 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.05 
 
 
325 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 
305 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.6 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  34.47 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  30.23 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  31 
 
 
311 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 
301 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  32.87 
 
 
313 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  30.22 
 
 
301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 
289 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  29.5 
 
 
316 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  32.31 
 
 
310 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  31.39 
 
 
323 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.31 
 
 
305 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  30.85 
 
 
307 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  27.76 
 
 
295 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  30.97 
 
 
295 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  31.68 
 
 
333 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.68 
 
 
318 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  31.27 
 
 
287 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  30.5 
 
 
307 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  28.68 
 
 
304 aa  106  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  31.14 
 
 
289 aa  106  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  28.21 
 
 
331 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>