More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1854 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  589  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  43.62 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  38.1 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  33.22 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  32.12 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  33.77 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  33.77 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  33.89 
 
 		 334 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  33.09 
 
 		 314 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  31.6 
 
 		 324 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  33.89 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  31.91 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  32.25 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  30.9 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  32.09 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  32.09 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  31.03 
 
 		 295 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  33.09 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  28.37 
 
 		 331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  30.2 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  32.89 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  31.89 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  34.3 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  36.48 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  30.9 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  26.3 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  32.51 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  26.3 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  32.2 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  30.84 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  27.68 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  31.27 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  29.55 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  31.88 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  26.94 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  31.86 
 
 		 304 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  30.77 
 
 		 311 aa  95.9  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.8 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  29.93 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  29.49 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  29.09 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  31.53 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  29.31 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  31.02 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  29.96 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  30.34 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 		 290 aa  92.4  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  29.67 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  29.67 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  30.9 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  30.94 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  28.52 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 318 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  31.35 
 
 		 279 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  28.52 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  31.33 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  28.2 
 
 		 292 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  28.52 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  28.14 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  27.66 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.16 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  30.39 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  27.92 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  29.73 
 
 		 269 aa  86.7  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  28.47 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.08 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  28.17 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  27.78 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.05 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  28.62 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  31.36 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.83 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  26.25 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  25.94 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  31.33 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  28.62 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  26.64 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  26.06 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  31.7 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  27.62 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  27.64 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  27.64 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  24.46 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  27.23 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  29.37 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  29.34 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  29.91 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  29.17 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>