More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0158 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.54 
 
 
298 aa  236  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  47.5 
 
 
285 aa  221  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  31.06 
 
 
317 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  36.49 
 
 
281 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  31.56 
 
 
315 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  34.84 
 
 
292 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  33.77 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  35.69 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  33.56 
 
 
292 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  31.74 
 
 
324 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  34.47 
 
 
308 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  32.42 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  30.31 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  29.45 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  32.43 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  29.17 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  38.23 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  29.47 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  32.03 
 
 
289 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  34.13 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  34.13 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  32.76 
 
 
317 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.77 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  32.88 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  32.76 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  33.22 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  33.77 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  28.21 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  32.42 
 
 
318 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  36.1 
 
 
317 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  32.52 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  29.01 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  31.82 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  29.45 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  32.39 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.07 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  34.77 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  29.49 
 
 
309 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  33.11 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.53 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  31.19 
 
 
311 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  30.85 
 
 
295 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  31.69 
 
 
317 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.27 
 
 
312 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  33.45 
 
 
303 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 
312 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  26.89 
 
 
312 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  32.33 
 
 
334 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  31.93 
 
 
306 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  31.96 
 
 
317 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  30.88 
 
 
292 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 
328 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  29.82 
 
 
294 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  29.82 
 
 
294 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  28.05 
 
 
342 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
305 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  31.18 
 
 
289 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  31.6 
 
 
316 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  28.53 
 
 
333 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  32.4 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  31.71 
 
 
318 aa  99.4  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  30.56 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  28.77 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  30.38 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  30.18 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  29.14 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  30.95 
 
 
314 aa  96.3  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  35.59 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  27.56 
 
 
281 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  30.54 
 
 
295 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  28.77 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  27.56 
 
 
281 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  31.52 
 
 
294 aa  95.5  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  29.79 
 
 
301 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  27.56 
 
 
281 aa  95.9  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.8 
 
 
306 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  32.49 
 
 
288 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.03 
 
 
333 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  27.87 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  30.46 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  33.69 
 
 
310 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  33 
 
 
347 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
289 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  31.02 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  28.83 
 
 
334 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  27.18 
 
 
303 aa  92.4  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
318 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  34.52 
 
 
327 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  27.04 
 
 
317 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  28.28 
 
 
306 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.09 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  31.77 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  35.33 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2847  hypothetical protein  33.45 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>