292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3292 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  561  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  40.85 
 
 		 288 aa  198  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  39.74 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  41.26 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  37.92 
 
 		 277 aa  182  6e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  39.72 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  39.25 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  35.74 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  37.37 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  34.88 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0952  putative transmembrane protein  37.21 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.493794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1034  putative transmembrane protein  37.21 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0651009 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 		 329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.44 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1497  putative transmembrane protein  37.14 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  36.16 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  39.1 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3279  putative transmembrane protein  36.54 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  37.05 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  39.03 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1567  putative transmembrane protein  35.2 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  33.45 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  33.57 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  33.09 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  31.7 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  31.42 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  27.6 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  27.6 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  27.6 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  30.77 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  30.34 
 
 		 317 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  29.37 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  29.78 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  30.25 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  29.9 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  27.86 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  29.31 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  29.35 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  30.42 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  28.78 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.73 
 
 		 277 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  27.24 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  29.57 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  29.35 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  30.83 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  25.93 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.09 
 
 		 324 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  27.7 
 
 		 295 aa  95.5  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.93 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  28 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  30.99 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.56 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  28.57 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  28.57 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  27.96 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  27.66 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  26.84 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  26.84 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  26.84 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  26.38 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  27.86 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  27.84 
 
 		 284 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  31.87 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  28.21 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  26.35 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  27.59 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  29.08 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  27.7 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  28.47 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  29.08 
 
 		 305 aa  86.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  28.9 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  29.43 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.82 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  25.77 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  28.21 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  28.76 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  29.37 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  29.19 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  26.89 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  29.68 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  30.51 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  28.38 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  28.38 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  26.52 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  26.52 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  26.52 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  29.39 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>