More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5553 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  97.18 
 
 		 284 aa  524  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  70.92 
 
 		 334 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  55.2 
 
 		 281 aa  312  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  55.2 
 
 		 281 aa  311  6.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  55.2 
 
 		 281 aa  311  6.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.14 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  34.3 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  32.58 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  32.96 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  32.95 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  31.6 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  32.96 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  32.61 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  33.7 
 
 		 301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  30.97 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  29.63 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  35.48 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  31.11 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  32.88 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  27.54 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  34.32 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  30.51 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  33.82 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  31.16 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  33.82 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  31.75 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  29.85 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  31.39 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  30.47 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  31.6 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  32.72 
 
 		 324 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  34.58 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  30.99 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  34.58 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  31.6 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  34.16 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  24.47 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  30.14 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  30.18 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  34.52 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  24.47 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  25.7 
 
 		 288 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  34.16 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  34.16 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.62 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  28.62 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  32.8 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  32.99 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.58 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 273 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  33.45 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  29.86 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  32.86 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  33.1 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  30 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  27.74 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  28.52 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  29.79 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  29.5 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  28.26 
 
 		 310 aa  92  9e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1567  putative transmembrane protein  30.38 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  31.16 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  25.17 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  32.84 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  28.88 
 
 		 313 aa  89  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  31.79 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  24.91 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  28.21 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  25.45 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  25.63 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  27.31 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  25.27 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  30.77 
 
 		 314 aa  86.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  28.32 
 
 		 327 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  27.6 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  26.74 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  31.06 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  26.74 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  34.63 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  26.59 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  28.68 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  24.73 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  31.87 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1497  putative transmembrane protein  35.56 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  30.5 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>