More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0393 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  71.28 
 
 
284 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  70.92 
 
 
284 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  48.9 
 
 
281 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  48.9 
 
 
281 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  48.9 
 
 
281 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  31.48 
 
 
302 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 
277 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  31.11 
 
 
302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  29.04 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  31.87 
 
 
273 aa  126  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  33.57 
 
 
301 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  28.68 
 
 
296 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  31.02 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  28.32 
 
 
296 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  30.66 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  31.41 
 
 
292 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  29.89 
 
 
291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  28.72 
 
 
296 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.69 
 
 
283 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  31.64 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  29.01 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  31.82 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  32.74 
 
 
294 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  25.55 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  32.38 
 
 
296 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  30.91 
 
 
291 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  28.88 
 
 
306 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 
273 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
273 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  29.96 
 
 
288 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  31.52 
 
 
287 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  29.96 
 
 
288 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  24.45 
 
 
302 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  31 
 
 
307 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  32.03 
 
 
287 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  31.52 
 
 
287 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  33.88 
 
 
334 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  29.45 
 
 
324 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  29.21 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  28.87 
 
 
317 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
297 aa  99  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  30.36 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  30.29 
 
 
277 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  31.69 
 
 
324 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  28.41 
 
 
269 aa  95.5  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  29.24 
 
 
297 aa  95.1  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31 
 
 
329 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31 
 
 
329 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  32.75 
 
 
305 aa  92.8  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  28.83 
 
 
301 aa  92.8  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  29.2 
 
 
285 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  31.49 
 
 
298 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  26.33 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 
291 aa  90.1  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  24.31 
 
 
288 aa  89.7  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  27.59 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1567  putative transmembrane protein  30.23 
 
 
305 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  28.72 
 
 
318 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  28.72 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0647  transporter, drug/metabolite exporter family  27.24 
 
 
297 aa  87  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000726353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0750  UAA family protein  27.24 
 
 
297 aa  87  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000936326  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  29.47 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  29.47 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  29.47 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  26.96 
 
 
299 aa  86.3  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  25.61 
 
 
312 aa  86.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  28.26 
 
 
310 aa  86.3  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  25.93 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 
307 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  25.93 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 
298 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  25.93 
 
 
310 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  29.37 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  27.46 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  25.85 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1128  hypothetical protein  33.16 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  26.01 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  26.44 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  27.51 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  29.93 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  28.88 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  28.47 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  28.57 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.7 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  27.38 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  27.14 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  28.22 
 
 
311 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  27.52 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  28.16 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  24.82 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0952  putative transmembrane protein  31.25 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.493794  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  24.44 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  29.31 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  23.1 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  27.14 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.38 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>