More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0400 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  579  1e-164  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.1 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  54.05 
 
 		 296 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  47.04 
 
 		 296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  44.79 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  43.97 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  45.77 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0408  integral membrane protein  45.1 
 
 		 310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0434  integral membrane protein  44.79 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.6 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  32.88 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  32.88 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  29.79 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  30.74 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  30.74 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  30.74 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  32.88 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  30.14 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  29.79 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  28.27 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  26.39 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  31.34 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  25.93 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  25.69 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  26.62 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  31.01 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  25.34 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  25.67 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  29.21 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  27.92 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  25.33 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  30.71 
 
 		 304 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  28.92 
 
 		 298 aa  95.9  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  27.7 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  26.55 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  28.48 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  26.89 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  27.76 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.14 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  28.82 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  24.92 
 
 		 334 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  28.52 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  28.81 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  28.57 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  27.24 
 
 		 303 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  28.37 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  26.55 
 
 		 269 aa  89.4  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  31.12 
 
 		 287 aa  89  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  28.24 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  27.34 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  25.8 
 
 		 331 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  27.09 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  30.77 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  23.43 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  23.51 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  29.62 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  27.39 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  30.33 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  27.11 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  26.41 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.84 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1567  putative transmembrane protein  28.62 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  25.61 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0760  hypothetical protein  26.22 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  25.75 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  27.49 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  24.36 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  24.36 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  24.36 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  27.38 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  30.19 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6087  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.866624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1128  hypothetical protein  29.91 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  27.05 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  27.05 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  24.75 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1171  hypothetical protein  28.63 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.865104 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  25.09 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  24.07 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  26.74 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  28.09 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  26.46 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  26.69 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  27.4 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  21.43 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  23.45 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0774  hypothetical protein  24.54 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  24.74 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>