More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0932 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 312 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  94.23 
 
 		 312 aa  590  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  66.67 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  64.52 
 
 		 312 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  55.52 
 
 		 300 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  54.46 
 
 		 319 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  54.9 
 
 		 338 aa  308  9e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  54.58 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  52.12 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  50.49 
 
 		 318 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  50.16 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  52.92 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  47.37 
 
 		 313 aa  248  9e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2291  hypothetical protein  45.93 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  0.288428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  42.43 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  37.41 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  42.18 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.47 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.84 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  34.14 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  30.64 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  32.71 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  33.6 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.97 
 
 		 307 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.25 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  31.27 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  29.02 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  31.85 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  28.62 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  27.89 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  32.31 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  29.64 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  28.18 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  28.87 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  29.55 
 
 		 299 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  30.27 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  26.25 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  35.11 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  27.93 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  29.32 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  29.55 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  28.97 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  28.72 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  23.78 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  26.8 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  31.37 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  26.8 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  29.08 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  25.85 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  29.47 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  27.93 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  29.3 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  28.77 
 
 		 307 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  29.84 
 
 		 347 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  29.12 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  28.43 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 333 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  29.02 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  28.62 
 
 		 292 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  30.47 
 
 		 273 aa  95.9  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  27.42 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  29.04 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  27.92 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  27.86 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  27.87 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  24.74 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.58 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  26.74 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  27.92 
 
 		 292 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  27.19 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  26.07 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  27.99 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  25.89 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  25.89 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  29.26 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  30.54 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  27.64 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  28.14 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  29.17 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  27.03 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 		 283 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  28.42 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  27.27 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  30.4 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 318 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  27.92 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  27.56 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  27.18 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  27.51 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>