More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0257 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 273 aa  532  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.7 
 
 		 273 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  32.26 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  30.51 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  32.68 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  30.53 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  30.51 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  30.51 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.34 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  31.27 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  30.66 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  28.78 
 
 		 334 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  27.64 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  30.55 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  28.36 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  29.86 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  29.82 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  29.82 
 
 		 318 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  26.9 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  27.82 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  26.74 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  29.84 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1824  hypothetical protein  28.68 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  30.42 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  25.61 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  28.21 
 
 		 302 aa  99.4  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.67 
 
 		 324 aa  98.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  27.44 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  30.94 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  29.55 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  28.72 
 
 		 302 aa  95.9  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 		 333 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 		 305 aa  95.5  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  28.83 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  26.91 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  31.62 
 
 		 327 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  28.94 
 
 		 285 aa  92.8  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  30.42 
 
 		 313 aa  92  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  28.07 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  31.62 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  26.41 
 
 		 297 aa  91.3  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  27.72 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  26.64 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  30.66 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  29.17 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.05 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  29.32 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  28.47 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  30.23 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  25.45 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  27.3 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  31.29 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 316 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 289 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  29.37 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  26.57 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  27.41 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  26.2 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  27.27 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  29.23 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09181  integral membrane protein, DUF6  27.54 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.190146  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  27.03 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  28.7 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 		 307 aa  82  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  24.59 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  27.06 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  27.88 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  28.47 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  27.84 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  25.27 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  28.16 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  29.37 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  26.43 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.08 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 325 aa  78.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  27.04 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  26.35 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  31.6 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  26.54 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  26.07 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  24.81 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  29.24 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  29.9 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  23.33 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  29.46 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  26.64 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  30.4 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  28.26 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1573  integral membrane protein  24.41 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  25.74 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  26.09 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  28.52 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>