164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2238 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2238  putative transmembrane protein  100 
 
 		 301 aa  587  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56405  normal  0.0304872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  59.93 
 
 		 305 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0952  putative transmembrane protein  61 
 
 		 303 aa  323  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.493794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1034  putative transmembrane protein  61 
 
 		 303 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0651009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3279  putative transmembrane protein  58.67 
 
 		 302 aa  295  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1743  putative transmembrane protein  52.82 
 
 		 303 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75968  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1497  putative transmembrane protein  53.2 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1567  putative transmembrane protein  53.36 
 
 		 305 aa  285  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2879  putative transmembrane protein  50.83 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.609035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  41.67 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2619  hypothetical protein  40.67 
 
 		 306 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3368  putative transmembrane protein  44.26 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2635  putative transmembrane protein  42.9 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0878  transmembrane protein  38.87 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.87 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2430  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.87 
 
 		 329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1265  hypothetical protein  41.67 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  38.33 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3292  hypothetical protein  34.88 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  35.35 
 
 		 277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3057  hypothetical protein  39.32 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.164646  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.67 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0747  hypothetical protein  30.54 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  31.65 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  31.31 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.3 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  31.86 
 
 		 334 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  30.9 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  31.84 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  31.49 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.34 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  33.56 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  24.52 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  28.1 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  27.96 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  27.96 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  25.63 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  27.96 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  28.91 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  29.89 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  26.87 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  29.92 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  27.8 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  25.76 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  25.16 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  26.16 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  27.21 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  27.36 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  26.45 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  29.39 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  27 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  26.79 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  26.79 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  24.29 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  26.3 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  28.9 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  26.01 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  29.73 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  24.45 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  26.62 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  25.95 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  26.62 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  29 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  28.62 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  27.93 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  27.93 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  27.93 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.62 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  26.21 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  27.92 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  28 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  20.94 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  27.84 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  24.83 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  26.33 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6087  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.866624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.92 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2600  hypothetical protein  26.98 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0233852 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  20.2 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  20.94 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  24.83 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  19.87 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  25.08 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  19.21 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  24.66 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  27.34 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  23.49 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  24.57 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  24.67 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  24.34 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  24.34 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3092  hypothetical protein  30.54 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  23.83 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>