More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04178 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  100 
 
 		 291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  57.14 
 
 		 306 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  56.07 
 
 		 305 aa  289  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  55.51 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.55 
 
 		 328 aa  145  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  36.75 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  32.75 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  35.69 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  31.54 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  34.72 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  34.15 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  33.8 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.46 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  31.93 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  33.69 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  32.51 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  31.87 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  31.87 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  31.85 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.16 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.25 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  31.62 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  31.05 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  30.41 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  31.01 
 
 		 306 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.29 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  31.03 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.59 
 
 		 318 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 		 305 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  29.25 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  28.72 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.93 
 
 		 320 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  29.25 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  31.14 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  29.57 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.87 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.7 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  28.91 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.9 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  34.32 
 
 		 317 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  31.62 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  29.2 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  29.37 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  33.18 
 
 		 309 aa  99.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  32.14 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  31.39 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2847  hypothetical protein  35.85 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  30.71 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  26.74 
 
 		 338 aa  99.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  28.77 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  30.71 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  29.12 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  26.92 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  30.18 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  28.21 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.73 
 
 		 322 aa  96.3  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  32.74 
 
 		 297 aa  96.3  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  26.39 
 
 		 338 aa  95.9  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  29.45 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.1 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  28.42 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  28.68 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  27.97 
 
 		 313 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  29.35 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  31.55 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  32.43 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  33.19 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  27.7 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  29.35 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  29.83 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  27.78 
 
 		 324 aa  92  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  27.36 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  27.18 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  31.25 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  25.61 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  26.38 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.07 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  31.5 
 
 		 292 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  28.2 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 		 312 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  31.25 
 
 		 310 aa  89  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  30.36 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  26.15 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  27.62 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  26.67 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  27.31 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  27.31 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  28.69 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  25.25 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  31.8 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>