More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0364 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  100 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  99.35 
 
 		 307 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  85.34 
 
 		 307 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  45.07 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  42.11 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.78 
 
 		 318 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.78 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  44.44 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  42.42 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  40.07 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  36.49 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.03 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.95 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  39.59 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  35.4 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  35.05 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  34.54 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.88 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  33.55 
 
 		 315 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  33.22 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.01 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  30.17 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  30.97 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  32.79 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.55 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  30.52 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  30.98 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  31.74 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  31.97 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  29.02 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  33.45 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  32.4 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  34.01 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  30.34 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  29.74 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  29.86 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.61 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  30.43 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  29.05 
 
 		 317 aa  96.3  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  28.2 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.57 
 
 		 301 aa  95.9  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  29.66 
 
 		 311 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  29.93 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  31.14 
 
 		 331 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  33.1 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  32.85 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  31.02 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  30.5 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  31.02 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  29.62 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  30.18 
 
 		 279 aa  92.8  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.19 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  30.36 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  29.79 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  29.01 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  30.14 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  30.64 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  31.92 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  30.48 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  29.24 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  31.79 
 
 		 317 aa  89.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  30.28 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  30 
 
 		 305 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  27.53 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  30.51 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  29.64 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  30.27 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  30.18 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.16 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  25 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  26.69 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  31.56 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  28.52 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  27.95 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  27.05 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  27.07 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3068  hypothetical protein  28.03 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  30.21 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  26.79 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  28.7 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  32.35 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  30.21 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  29.96 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  29.12 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  30.36 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2078  hypothetical protein  29.1 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  29.63 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  27.57 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  25.54 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>