292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0751 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  598  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  50.35 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  51.25 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  44.01 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  46.59 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.16 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  41.58 
 
 		 302 aa  195  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  38.89 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  43.21 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.28 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  38.11 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  37.94 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  41.75 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.24 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  36.46 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  36.46 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  38.79 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  36.55 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  36.95 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  36.27 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  36.27 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.92 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  35.92 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  34.04 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.55 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  36.39 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2502  hypothetical protein  35.51 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  33.44 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.45 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  32.31 
 
 		 331 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  30.74 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  32.54 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.71 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  28.96 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  34.48 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1038  hypothetical protein  32.88 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  31.51 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.87 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  31.51 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.01 
 
 		 313 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  32.08 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  29.66 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  30.66 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  27.7 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  28.15 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  31.53 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  28.52 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  32.53 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  30.27 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  27.97 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  31.08 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  33.57 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  29.77 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  30.9 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.93 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  30.74 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  28.19 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  26.35 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  27.54 
 
 		 291 aa  99.4  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  29.9 
 
 		 324 aa  99  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  31.79 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  30.28 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  32.52 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  27.52 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  29.35 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  31.46 
 
 		 307 aa  96.3  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  29.31 
 
 		 324 aa  95.9  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  28.03 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  31 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  30.67 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.59 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  30.03 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  33.48 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  30.95 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  29.9 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  27.27 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  29.32 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  29.08 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  28.77 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  27.83 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  29.25 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  29.25 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  28.67 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  29.26 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  26.46 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  27.97 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  30.79 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  26.63 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>