More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0141 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77.78 
 
 
292 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  69.04 
 
 
295 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  67.02 
 
 
294 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  68.42 
 
 
294 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  68.42 
 
 
294 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  55.99 
 
 
319 aa  310  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  52.22 
 
 
295 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.5 
 
 
293 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  47.35 
 
 
320 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.45 
 
 
293 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  47.55 
 
 
313 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  46.48 
 
 
301 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  37.72 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  36.14 
 
 
292 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  37.37 
 
 
292 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  34.62 
 
 
295 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  35 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  35.27 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  34.74 
 
 
292 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  35.09 
 
 
292 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  34.62 
 
 
311 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  34.97 
 
 
288 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  33.92 
 
 
317 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.92 
 
 
313 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  32.75 
 
 
311 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  32.5 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  34.16 
 
 
304 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.91 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  33.68 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 
305 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.18 
 
 
305 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  33.58 
 
 
295 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  30.14 
 
 
310 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.77 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  34.75 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  36.1 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  30.03 
 
 
312 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  32.51 
 
 
331 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  35.63 
 
 
308 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 
306 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  29.87 
 
 
309 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  30 
 
 
297 aa  122  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  30 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.13 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  35.13 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  32.77 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.23 
 
 
339 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.47 
 
 
331 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.9 
 
 
325 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  32.22 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  34.04 
 
 
306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  32.65 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  29.52 
 
 
300 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  30.36 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  31.8 
 
 
285 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
328 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  31.34 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  34.17 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 
305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  30.14 
 
 
310 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  30.17 
 
 
317 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  37.69 
 
 
305 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.28 
 
 
298 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  32.04 
 
 
306 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  29.17 
 
 
309 aa  106  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  32.38 
 
 
307 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  32.86 
 
 
321 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  30.71 
 
 
302 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.82 
 
 
318 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  28.48 
 
 
305 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  31.91 
 
 
310 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  33.83 
 
 
295 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  34.18 
 
 
317 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  31.06 
 
 
288 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  26.32 
 
 
291 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 
318 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  31.18 
 
 
301 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  31.84 
 
 
342 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3066  membrane protein  35.97 
 
 
194 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.055034  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  25.69 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  35.15 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 
318 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 
302 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  32.29 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  25.87 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  28.42 
 
 
299 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  29.45 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  31.89 
 
 
303 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  36.68 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  36.95 
 
 
279 aa  92.8  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  29.41 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  29.41 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  29.41 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  29.15 
 
 
324 aa  92.4  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  32.87 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  30.74 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>