More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0143 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  91.84 
 
 		 294 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  91.5 
 
 		 294 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  67.02 
 
 		 289 aa  388  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.5 
 
 		 292 aa  371  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  62.2 
 
 		 295 aa  357  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  53.95 
 
 		 319 aa  299  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.02 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  46.59 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.33 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  47.87 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  47.37 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  45.33 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  38.16 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  38.16 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  35.13 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  36.82 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  36.46 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  36.2 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  35.13 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  34.05 
 
 		 292 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.23 
 
 		 314 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  34.97 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  34.16 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  35.31 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  36.93 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  33.08 
 
 		 294 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  33.45 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.35 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  35.07 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  34.27 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  34.08 
 
 		 295 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  33.79 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  33.68 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.21 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  34.26 
 
 		 347 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.26 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  35.76 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  34.72 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  35.02 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  31.96 
 
 		 331 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  32.03 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  29.97 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  33.22 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.06 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  33.95 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  31.56 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  36.73 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  32.67 
 
 		 320 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.84 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  30.48 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  32.33 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  32.06 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  29.47 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  28.68 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.58 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  27.76 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  27.76 
 
 		 309 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  32.28 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  25.9 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  29.07 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.77 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  29.93 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  27.36 
 
 		 342 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  30.71 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  37.29 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  29.73 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  30.3 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  31.86 
 
 		 305 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  34.84 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  37.29 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  31.16 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  25.83 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  30.47 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  29.55 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  33.05 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  38.69 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  33.9 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  28.98 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  30.88 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3066  membrane protein  39.72 
 
 		 194 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.055034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  30.38 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  31.65 
 
 		 286 aa  99.4  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  29.62 
 
 		 302 aa  99  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  30.51 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  27.46 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  30.38 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  37.89 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  30.03 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  30.74 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  28.76 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  29.11 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  29.12 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>