145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3066 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3066  membrane protein  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.055034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  43.07 
 
 		 320 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.57 
 
 		 292 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  35.97 
 
 		 289 aa  99  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  37.23 
 
 		 295 aa  95.5  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  39.72 
 
 		 294 aa  91.7  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.31 
 
 		 313 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  39.42 
 
 		 294 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  39.42 
 
 		 294 aa  88.6  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  40.28 
 
 		 311 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  39.72 
 
 		 319 aa  85.5  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  37.96 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  36.36 
 
 		 310 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  36.18 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  32.68 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.5 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  32.9 
 
 		 319 aa  78.6  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  38.4 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  36.76 
 
 		 301 aa  75.1  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  39.34 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  28.05 
 
 		 331 aa  72  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  30.87 
 
 		 292 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  29.53 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.33 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  30.87 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  35.77 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  32.9 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  27.94 
 
 		 312 aa  62  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  33.08 
 
 		 289 aa  61.6  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  27.21 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  28.66 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  29.25 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  35.71 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  29.25 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  35.25 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  29.25 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  34.06 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  32.09 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  32 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  32.43 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  58.2  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  28.19 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  30.71 
 
 		 285 aa  57  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  30.19 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  34.07 
 
 		 304 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  27.61 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  29.5 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  26.88 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  32.12 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  34.56 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.94 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  30.41 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  31.69 
 
 		 302 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  30.13 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.38 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  27.94 
 
 		 300 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  30.14 
 
 		 301 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  27.86 
 
 		 337 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  25.17 
 
 		 310 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 305 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  31.76 
 
 		 306 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 318 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 312 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  29.01 
 
 		 316 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  31.69 
 
 		 288 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 308 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  30.87 
 
 		 319 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  30.97 
 
 		 314 aa  51.6  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  31.08 
 
 		 313 aa  51.6  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  31.34 
 
 		 317 aa  51.6  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  24.83 
 
 		 312 aa  51.2  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  32.37 
 
 		 288 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  27.91 
 
 		 304 aa  50.1  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  31.65 
 
 		 288 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.41 
 
 		 301 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 		 289 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 316 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  32.82 
 
 		 295 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 318 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  26.87 
 
 		 285 aa  48.5  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  28.91 
 
 		 288 aa  48.5  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 		 287 aa  47.8  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  29.08 
 
 		 294 aa  47.8  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  29.69 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  29.69 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  29.69 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  32.37 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  28.89 
 
 		 316 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  35.15 
 
 		 347 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.57 
 
 		 339 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  26.87 
 
 		 291 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  28.89 
 
 		 306 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 		 318 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>