More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5401 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 291 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  88.85 
 
 		 288 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  39.69 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  34.83 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.21 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  31.23 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  32.83 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  28.79 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  30.22 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  31.63 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  30.4 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  32.03 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  29.08 
 
 		 307 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.25 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  27.57 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  26.04 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.22 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  30.14 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  29.79 
 
 		 292 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  30.14 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  31.71 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  30.43 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.95 
 
 		 339 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  30.39 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  28.11 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  32.94 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001435  putative transporter DME family  29.18 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100251  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  31.11 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  29.6 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  28.85 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  29.54 
 
 		 311 aa  89.4  6e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 305 aa  89  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 333 aa  89  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  30.86 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  29.35 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  31.28 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  27.52 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  28.86 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  32.31 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  28.78 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  30.94 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  31.6 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  27.34 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  31.6 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  28.41 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  31.92 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  29.81 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  26.23 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  30.45 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  29.25 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  26.95 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1899  hypothetical protein  33.08 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  30.97 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  28.08 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  29.01 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  30.18 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  29.26 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  28.94 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.84 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  28.88 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  26.76 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  32.25 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  27.96 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  30.08 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  29.58 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  28.86 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  24.62 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  28.86 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  25.82 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0883  hypothetical protein  31.75 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.972972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  26.1 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  28.12 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  30.89 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  28.4 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  30.24 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  26.79 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  34.07 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  31.58 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  28.4 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  28.4 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  33 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  28.78 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  28.72 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  34.87 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  30.77 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.09 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  29.78 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  27.56 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  29.78 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  27.9 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  24.73 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  28.06 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>