More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001435 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001435  putative transporter DME family  100 
 
 		 285 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  88.17 
 
 		 279 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  79.65 
 
 		 298 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  79.43 
 
 		 294 aa  448  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0035  hypothetical protein  43.16 
 
 		 284 aa  221  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2496  hypothetical protein  45.91 
 
 		 297 aa  195  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.580148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.69 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1342  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.83 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.6 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  29.93 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2145  hypothetical protein  35.29 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  34.84 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  31.44 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  31.44 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  26.88 
 
 		 289 aa  99.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  29.08 
 
 		 285 aa  99  9e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.19 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.08 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  31.76 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  30.94 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  31.78 
 
 		 301 aa  95.5  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  34.08 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  31.47 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  30.5 
 
 		 331 aa  93.2  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35 
 
 		 314 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  32.3 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  31.1 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  30.12 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5355  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 288 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  29.11 
 
 		 309 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.95 
 
 		 325 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  31.2 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  26.52 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  31.2 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  30.4 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  29.61 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  28.5 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  26.48 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  33.49 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  30.74 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  31.65 
 
 		 295 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  28.98 
 
 		 342 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  34.21 
 
 		 294 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  27.76 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  30.08 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  29.6 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  28.18 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  28.31 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  27.7 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  31.71 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  28.88 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  31.19 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  29.26 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  29.68 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  29.76 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  31.9 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  30.05 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  27.93 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  26.91 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  31.19 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  30.65 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  33.16 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  29.24 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  29.59 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  29.59 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  29.34 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  33.16 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  29.32 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  30.66 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.89 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4941  hypothetical protein  26.21 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  26.81 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  28.96 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  28.25 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  26.38 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4970  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  25.81 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.98 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  28.74 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  27.48 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  27.98 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  26.39 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.84 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  26.55 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  29.21 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.41 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  27.3 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  29.49 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  29.85 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>