269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2209 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3630  hypothetical protein  58.06 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3068  hypothetical protein  52.9 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3175  hypothetical protein  53.82 
 
 		 299 aa  252  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2078  hypothetical protein  51.27 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  32.96 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  31.96 
 
 		 312 aa  99.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  31.96 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 333 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 339 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.96 
 
 		 306 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 		 318 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  32.73 
 
 		 317 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  30.9 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  30.4 
 
 		 315 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  31.64 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  33.63 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  31.82 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  31.05 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  26.03 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  32.85 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  32.62 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  31.25 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  30.56 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  29.25 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  30.23 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  31.69 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  30.14 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  30.23 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  29.64 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  31.94 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  33.68 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  33.68 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  30.28 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  31.84 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  26.35 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  31.3 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  31.3 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  29.97 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  26.97 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.02 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.5 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  28.73 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  32.53 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  29.95 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  32.53 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.53 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  31.16 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  31.71 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  30.89 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  27.63 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  30.48 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  32.13 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  31.3 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  32.23 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.64 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  28.72 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  34.8 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  28.26 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  27.44 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  28.62 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  34.36 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  31.45 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  34.29 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  29.85 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0255  hypothetical protein  32.17 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  28.27 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1600  drug/metabolite exporter (DME) family protein  32.17 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  31.28 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  30.5 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  24.83 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  32.32 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  30.33 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  29.74 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  31.43 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  30.33 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  31.43 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  33.85 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  32.87 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  29.86 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  28.79 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  27.41 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  32.65 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  26.6 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  28.19 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  28.47 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  33.67 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  33.67 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  27.84 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  29.35 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  30.05 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  30.33 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>