More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1569 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  93.62 
 
 		 283 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  92.91 
 
 		 283 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  93.62 
 
 		 283 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  89.01 
 
 		 283 aa  487  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  89.01 
 
 		 283 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  89.01 
 
 		 283 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  88.3 
 
 		 283 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  66.9 
 
 		 290 aa  368  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  37.3 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  34.29 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  34.29 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  35.69 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  33.93 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  35.59 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.93 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  35.23 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  35.23 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  32.74 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  28.83 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  34.39 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  30 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  31.72 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  31.1 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  35.07 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  32.86 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  29.97 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  29.81 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  29.75 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  29.39 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  29.96 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  29.23 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  29.66 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  28.19 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  28.11 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  28.52 
 
 		 342 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1856  hypothetical protein  26.35 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  29.51 
 
 		 331 aa  85.5  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000693  hypothetical protein  30.88 
 
 		 215 aa  85.5  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  26.45 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  26.06 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  32.27 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  26.44 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  27.24 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  28.87 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  29.39 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  29.55 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  29.33 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  28.27 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  25.27 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  30.48 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  27.37 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  25.74 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  27.69 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  28.45 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1275  hypothetical protein  25.1 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.111691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  28.45 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1221  hypothetical protein  25.51 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  27.31 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  28.2 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  27.37 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  28.2 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  28.62 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  27.21 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  30.74 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  30.42 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  26.92 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  26.88 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  25.89 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  29.18 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  27.93 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  28.99 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  25.1 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  25.45 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  25.85 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  26.57 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  27.69 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  27.61 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  27.61 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  32.72 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  27.87 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  26.99 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  29.33 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  26.76 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  25.65 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  27.74 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  27.88 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>