251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3630 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3630  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  590  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  58.06 
 
 
276 aa  285  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2078  hypothetical protein  50.52 
 
 
287 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3068  hypothetical protein  53.52 
 
 
299 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3175  hypothetical protein  53.87 
 
 
299 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  31.47 
 
 
310 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  30.91 
 
 
290 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 
339 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 
333 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  29.43 
 
 
347 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  30.14 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
314 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  32.16 
 
 
292 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  34.48 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  30.48 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  30.99 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  30.5 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.11 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  34.34 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  31.88 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  26.12 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  30.22 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  25.91 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  27.67 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  28.48 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  30.41 
 
 
292 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.67 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  31.45 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  28.91 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  32.85 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  31.88 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  29.83 
 
 
292 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  26.55 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  29.51 
 
 
304 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  33.02 
 
 
295 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  33.18 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.27 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  31.56 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  27.84 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  29.84 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  28.25 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  28.7 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  29.49 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  31.07 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  31.09 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  28.24 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  28.05 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  30.65 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  28.21 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  31.31 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  29.19 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  30.37 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  30.17 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  32.29 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  30.45 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  30.45 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  31 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  32.07 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  27.87 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  31.77 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  31.16 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  31.77 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  28.74 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  30.54 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  29.95 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1038  hypothetical protein  32.6 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  28.57 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  30.48 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.79 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  29.92 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  27.74 
 
 
317 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  28.14 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  29.49 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  26.84 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  26.36 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  26.89 
 
 
320 aa  62.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  29.81 
 
 
301 aa  62.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  31.03 
 
 
306 aa  62.4  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  26.89 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  27.89 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  29.23 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  31.1 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2847  hypothetical protein  32.99 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  27.93 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  30.49 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  28.02 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  31.25 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  28.02 
 
 
294 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>