More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2716 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2716  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  39.26 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  39.1 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2053  RarD family protein  41.61 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.163977  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.93 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0255  hypothetical protein  28.76 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1600  drug/metabolite exporter (DME) family protein  28.76 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  30.61 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 		 305 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  27.45 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.71 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  28.8 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0283  hypothetical protein  29.64 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  27.56 
 
 		 294 aa  86.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.54 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  29.84 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  26.69 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  27.33 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  29.02 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  32.53 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  26.5 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.66 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  28.1 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  26.4 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  26.07 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  28.1 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  27.3 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  33.49 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  26.5 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  27.76 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  27.68 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  29.83 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  26.18 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  29.39 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  27.59 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  28.25 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  29.89 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  26.2 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  27.48 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  27.24 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  22.91 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  27.18 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  28.04 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  27.95 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  29.94 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2502  hypothetical protein  27.57 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  28.47 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  28.47 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  30.07 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  25.55 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  30.07 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  26.95 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  27.66 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  26.64 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  25.17 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  29.33 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  25.17 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.88 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  28.08 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  25.97 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  25.68 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  31.51 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  29.15 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  24.77 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  26.34 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  29.66 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  27.42 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  29.77 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  23.79 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  25.86 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  31.32 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  24.92 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  31.14 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  30.14 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  25.33 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  25.86 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  25.39 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  25.48 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.55 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  25.65 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  24.32 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.68 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  28.81 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  28.05 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  25.34 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  26.1 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  25.08 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  24.92 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  24.74 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>