42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2506 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.19 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.75 
 
 		 301 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  30.2 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  30.18 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  30.66 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  27.14 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  28.37 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  24.14 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  30.8 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  28.93 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  28.62 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  30.55 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  29.89 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  28.77 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  28.74 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  29.08 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  29.68 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  27.34 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  25.54 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 		 302 aa  52.8  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0900  hypothetical protein  29.37 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.16 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.69 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  25.34 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  29.54 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 288 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  23.43 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  24.56 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>