57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1705 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  578  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  61.81 
 
 		 291 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  59.67 
 
 		 297 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  62.82 
 
 		 280 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.53 
 
 		 309 aa  298  9e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  60.69 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  60.42 
 
 		 291 aa  285  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.39 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  57.69 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  33.58 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  30.22 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  32.82 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  30.25 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  33 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.83 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  26.85 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.83 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.83 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.07 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  29.64 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  30.84 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.23 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  27.1 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.55 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  26.69 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  26.74 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  28.03 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  25.98 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  29.61 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  26.79 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.35 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.37 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  25.2 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  29.44 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  24.48 
 
 		 281 aa  46.2  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  24.48 
 
 		 281 aa  46.2  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  24.14 
 
 		 281 aa  46.2  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.89 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  28.5 
 
 		 219 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  30.71 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  32.5 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  30.71 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.43 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  20.2 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  22.71 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  27.04 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  24.81 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.53 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  31.02 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  21.72 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  33.02 
 
 		 316 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0543  hypothetical protein  28.4 
 
 		 271 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.530705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  24.91 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  22.98 
 
 		 302 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>