73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1395 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77.78 
 
 		 306 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  76.14 
 
 		 306 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  57.84 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  50.18 
 
 		 333 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  48.42 
 
 		 338 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  49.12 
 
 		 313 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  48.42 
 
 		 338 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  48.42 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  48.07 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  48.42 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  49.47 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  48.32 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  46.83 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  48.66 
 
 		 315 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  48.99 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  49.15 
 
 		 825 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  47.99 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  47.99 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  47.99 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  47.99 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.48 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  38.33 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  37.63 
 
 		 328 aa  142  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  37.37 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  36.04 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  35.91 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  33.8 
 
 		 309 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.46 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  36.24 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  34.89 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  34.89 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  29.55 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  34.47 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  35.04 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  27.65 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  32.74 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  34.45 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  30.66 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  33.2 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  28.09 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.17 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  27.54 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  26.79 
 
 		 219 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  29.79 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  31.97 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  31.97 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  32.65 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  31.97 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  31.56 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  32.93 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  28.88 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.37 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  26.63 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  24.62 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  31.56 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  30.41 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  27.59 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  30.23 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  28.45 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  24.75 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  32.33 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  29 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  28.48 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  27.23 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  26.53 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  26.53 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  24.06 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>