69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0309 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  565  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.78 
 
 		 313 aa  311  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  66.43 
 
 		 313 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  62.56 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  49.18 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  53.56 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  52.96 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.65 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  50.18 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  53.6 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  34.62 
 
 		 333 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  34.2 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  33.88 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  35.67 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  34.65 
 
 		 313 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  35.33 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  35.33 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  34.69 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  37.29 
 
 		 341 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  35.22 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  34.11 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.63 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  32.9 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  31.21 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  29.87 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  34.98 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.86 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  35.22 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  34.87 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.47 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  28.82 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  33.89 
 
 		 825 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  34.55 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  34.55 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  34.55 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  34.55 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  36.55 
 
 		 249 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  36.55 
 
 		 249 aa  92.8  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.48 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0270  DMT family permease  24.77 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09391  integral membrane protein, DUF6  23.85 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0270489  normal  0.150561 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.85 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.97 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.95 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  26.12 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.15 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.34 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  40.51 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  23.5 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  28.9 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  28.9 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  28.9 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  28.9 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.44 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  28.9 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  28.9 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  39.51 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  28.9 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  37.5 
 
 		 299 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2225  hypothetical protein  29.22 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  29.74 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  27.45 
 
 		 304 aa  42.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>