71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1332 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 306 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  94.12 
 
 		 306 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  77.78 
 
 		 306 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  57.38 
 
 		 341 aa  295  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  51.76 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  48.94 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  48.59 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  47.89 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  48.24 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  48.24 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  48.24 
 
 		 338 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  52.11 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  48.24 
 
 		 313 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  49.3 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.11 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  49.65 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  50.18 
 
 		 825 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  48.94 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  48.94 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  48.94 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  48.94 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  49.3 
 
 		 329 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  39.58 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  39.07 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  40.73 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  36.77 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  36.39 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.86 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.59 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  36.76 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  36.24 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  32.16 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  34.3 
 
 		 249 aa  99.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  34.3 
 
 		 249 aa  99.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  35.98 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  27.03 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  33.94 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  34.18 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  34.27 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  32.51 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  30.47 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.31 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  31.33 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  33.16 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.2 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  31.19 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  32.13 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  32.13 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.92 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  28.99 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  26.96 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  31.73 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  31.73 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  29.25 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  31.71 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  30.54 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  27.65 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.47 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  29.13 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.25 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.22 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02797  hypothetical protein  28.16 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.605573  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  30.1 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  25.68 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7043  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.27 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497948  normal  0.0116084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>