48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0251 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  511  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  69.86 
 
 
313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.86 
 
 
313 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  62.56 
 
 
299 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.28 
 
 
296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  50.48 
 
 
304 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  55.88 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  46.36 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  55.15 
 
 
309 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  56.73 
 
 
312 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  36.04 
 
 
333 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  34 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  33.5 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  33.5 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  33.5 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  34 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  33.5 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  33.16 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  40.77 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  35.68 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  36.36 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  32.66 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  40.77 
 
 
825 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 
311 aa  75.5  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  40.77 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  40.77 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  40.77 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  40.77 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  40.77 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.17 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  35.11 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  42.11 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.49 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  28.78 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.75 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  31.53 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  29.74 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  42.15 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  42.15 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  32.33 
 
 
334 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.86 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  37.18 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  43.42 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  31.11 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.61 
 
 
299 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  42.86 
 
 
299 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>