73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0486 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  594  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  64.84 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.03 
 
 		 296 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  62.64 
 
 		 302 aa  248  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  50.18 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  53.08 
 
 		 313 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.74 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  57.14 
 
 		 304 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  48.32 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  49.57 
 
 		 264 aa  199  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  37.68 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  35.93 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  35.49 
 
 		 338 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  35.93 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  35.49 
 
 		 338 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  35.49 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  37.02 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  37.19 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.44 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  34.92 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.89 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.1 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  34.03 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  32.43 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  33.79 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  31.82 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  34.48 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  31.14 
 
 		 284 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  31.4 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  33.79 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  34.48 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  34.14 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  34.14 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  34.14 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  34.14 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  34.48 
 
 		 825 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  32.72 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  32.72 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  37.74 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  28.93 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.49 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  33.59 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  32.58 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  29.58 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  26.07 
 
 		 292 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  26.7 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  31.21 
 
 		 304 aa  46.2  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  30.23 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  30.23 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  30.23 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  30.23 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  30.23 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  30.23 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  30.23 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  27.03 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  33.02 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  26 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  39.73 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.21 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  27.03 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2345  hypothetical protein  26.67 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182301  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  30 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.52 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  25.12 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  28.29 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.82 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  36.05 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  31 
 
 		 308 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.99 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>