55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1499 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  100 
 
 		 249 aa  484  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  484  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  37.66 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  34.2 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  34.2 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  34.2 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  33.91 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  35.06 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  34.63 
 
 		 313 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  34.67 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  31.69 
 
 		 333 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  34.63 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.3 
 
 		 311 aa  99.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  33.47 
 
 		 284 aa  99  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  35.53 
 
 		 309 aa  95.9  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.93 
 
 		 331 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  34.89 
 
 		 306 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.89 
 
 		 306 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  32.38 
 
 		 341 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  37.39 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.05 
 
 		 306 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  33.61 
 
 		 315 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  33.47 
 
 		 329 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  35.78 
 
 		 299 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  36.68 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  33.61 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  33.48 
 
 		 825 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  32.14 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  32.14 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  32.14 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  33.48 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.13 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  37.55 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  42.15 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.77 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  31.32 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  26.94 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 301 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  26.14 
 
 		 300 aa  49.3  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.29 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  32.24 
 
 		 312 aa  45.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.22 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  27.36 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  24.41 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  36.25 
 
 		 290 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  24.4 
 
 		 315 aa  42.4  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  27 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  23.94 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  27.39 
 
 		 317 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.18 
 
 		 318 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.32 
 
 		 323 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.29 
 
 		 315 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.54 
 
 		 301 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>