59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1564 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  98.73 
 
 
825 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  99.68 
 
 
315 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  99.05 
 
 
315 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  98.41 
 
 
315 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  94.6 
 
 
329 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  76.64 
 
 
313 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  76.97 
 
 
313 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  76.64 
 
 
338 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  76.64 
 
 
313 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  76.64 
 
 
313 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  76.64 
 
 
338 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  77.96 
 
 
313 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  67.19 
 
 
333 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  66.25 
 
 
331 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.49 
 
 
331 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  48.44 
 
 
341 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.94 
 
 
306 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.29 
 
 
306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  47.99 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  41.78 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  38.51 
 
 
328 aa  175  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  36.8 
 
 
304 aa  129  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  34.72 
 
 
299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.11 
 
 
296 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  32.58 
 
 
309 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  37.06 
 
 
309 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  32.14 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  32.14 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  30.23 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  34.15 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  32.95 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  35.2 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  29.02 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  27.76 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  32.5 
 
 
309 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  32.08 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  33.48 
 
 
402 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  30.42 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  30.42 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  30.42 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.22 
 
 
397 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  30 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  26.7 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
335 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  32.89 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  34.22 
 
 
353 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  34.22 
 
 
356 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  34.22 
 
 
356 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.29 
 
 
323 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.94 
 
 
315 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  34.88 
 
 
297 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>