60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0192 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 313 aa  594  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  98.4 
 
 		 313 aa  587  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  66.78 
 
 		 299 aa  342  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  69.86 
 
 		 264 aa  288  8e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  54.61 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.23 
 
 		 296 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  52.29 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  45.67 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  53.05 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  56.32 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  33.13 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  36.81 
 
 		 306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  32.59 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  33.12 
 
 		 338 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  33.12 
 
 		 338 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  33.12 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  33.12 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  32.91 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  32.8 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.14 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.33 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  36.18 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  34.69 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  38.24 
 
 		 249 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.59 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  38.24 
 
 		 249 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  32.9 
 
 		 328 aa  97.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  31.56 
 
 		 288 aa  95.9  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  31.67 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  30.39 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.68 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  31.83 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  31.19 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  30.1 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  29.87 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  29.87 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  29.87 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  29.87 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  31.6 
 
 		 825 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.93 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  28.43 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  28.43 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  28.43 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  28.43 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  28.43 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  28.43 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  28.43 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  27.92 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  28.3 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  29.45 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  32.2 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.45 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2608  transporter DMT superfamily protein  37.36 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  33.85 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.27 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  32.02 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>