64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1801 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  550  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  49.82 
 
 		 288 aa  258  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  32.39 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  30.67 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  33.47 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  33.47 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  32.41 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  27.72 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  31.38 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  32.07 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  32.07 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  31.08 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  30.74 
 
 		 313 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  29.81 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  25.86 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  34.14 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  30.1 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  26.71 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  28.12 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  30.39 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  28.77 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  30.19 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  29.74 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  28.77 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  26.6 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  28.42 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  28.42 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  28.42 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  28.42 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  29.02 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.65 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  26.79 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  28.82 
 
 		 825 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  28.99 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  24.57 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  23.02 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  25.84 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  22.88 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  21.69 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  27.36 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  22.26 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  22.26 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  21.86 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  21.69 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  22.49 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  21.69 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  21.92 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  22.09 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  25.11 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  25.19 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  25.19 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  24.14 
 
 		 301 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  26.36 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.26 
 
 		 307 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.68 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>