46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1538 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 311 aa  594  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  35.97 
 
 		 288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  32.45 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  32.69 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  32.91 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  32.91 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  29.32 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  29.58 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  29.39 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  29.39 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  32.2 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  28.98 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  28.67 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  29.81 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  29.68 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  29.49 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  28.98 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  30.26 
 
 		 331 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  29.3 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.61 
 
 		 306 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  31.07 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  31.95 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  29.87 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  29.3 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  31.9 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  28.66 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  28.98 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  30.49 
 
 		 825 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  27.48 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  28.66 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  28.66 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  28.66 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  29.87 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  29.82 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  27.42 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  29.19 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  33.08 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  31.63 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  23.79 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  25.48 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.34 
 
 		 397 aa  42.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>