70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2464 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
331 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  92.75 
 
 
331 aa  587  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  81.76 
 
 
333 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  64.35 
 
 
313 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  63.75 
 
 
338 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  64.05 
 
 
313 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  63.75 
 
 
338 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  63.75 
 
 
313 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  67.88 
 
 
313 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  64.05 
 
 
313 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  68.98 
 
 
825 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  69.83 
 
 
315 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  70.17 
 
 
315 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  69.49 
 
 
315 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  69.49 
 
 
315 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  69.49 
 
 
315 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  69.49 
 
 
315 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  71.19 
 
 
329 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  50.34 
 
 
341 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.11 
 
 
306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.71 
 
 
306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  48.25 
 
 
306 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  42.47 
 
 
328 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  39.46 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  36.84 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.81 
 
 
296 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  34.53 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  38.49 
 
 
309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  34.36 
 
 
299 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  34.8 
 
 
313 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  34.05 
 
 
249 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  34.05 
 
 
249 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.8 
 
 
313 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  36.57 
 
 
312 aa  97.1  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  34.67 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  28.87 
 
 
288 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  34.17 
 
 
264 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  29.62 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  33.07 
 
 
309 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  33.63 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  35.37 
 
 
402 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  33.63 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  33.63 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  32.24 
 
 
309 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  34.44 
 
 
397 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  33.19 
 
 
356 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  33.19 
 
 
356 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  33.19 
 
 
356 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  33.19 
 
 
356 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  27.69 
 
 
345 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  32 
 
 
309 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  32.24 
 
 
309 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  33.6 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  33.6 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  31.3 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  31.91 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.78 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  31.91 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  32.98 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  31.91 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.67 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.99 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  25.82 
 
 
219 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  26.41 
 
 
292 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  25.36 
 
 
292 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  35.42 
 
 
281 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.27 
 
 
282 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.27 
 
 
282 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>