91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3564 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  100 
 
 		 304 aa  568  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  55.74 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  53.05 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.63 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  53.63 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  50.87 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.87 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  55.98 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  56.62 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  50.48 
 
 		 264 aa  169  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  38.6 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  38.08 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  37.71 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  37.46 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  38.6 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  41.05 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  36.79 
 
 		 338 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  36.79 
 
 		 338 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  38.25 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.65 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  38.38 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  36.7 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.03 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  37.5 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.05 
 
 		 331 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  36.49 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  36.49 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  36.49 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  36.7 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  36.49 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  36.93 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  36.7 
 
 		 825 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  34.88 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  38.38 
 
 		 328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  30.85 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.24 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  37.33 
 
 		 249 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  37.33 
 
 		 249 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  31.47 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  31.07 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.07 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  31.07 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  31.07 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  31.07 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  31.07 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  31.07 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  30.51 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.95 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  30.51 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  27.24 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  27.24 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  27.65 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  28.92 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  25.86 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  28.92 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  26.63 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.75 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  23.23 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2011  putative transmembrane protein  33.14 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0258502  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.83 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  26.67 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.67 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2125  hypothetical protein  27.23 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2308  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  30.7 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  31.55 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.23 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  32.16 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  27.33 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  27.8 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  31 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  30.23 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  28.35 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0537  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF6 domain protein)  28.8 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  24.87 
 
 		 281 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  23.19 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  30.92 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.78 
 
 		 313 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  24.87 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  25.12 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  24.87 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  30.57 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2239  membrane protein  27.14 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.28 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.85 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3279  putative transmembrane protein  32.57 
 
 		 302 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  26.88 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>