51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5337 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  96.49 
 
 
338 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  96.49 
 
 
338 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  96.17 
 
 
313 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  94.57 
 
 
313 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  94.89 
 
 
313 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  92.65 
 
 
313 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  76.97 
 
 
315 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  77.3 
 
 
825 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  66.87 
 
 
333 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  76.97 
 
 
315 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  76.64 
 
 
315 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  76.64 
 
 
315 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  76.64 
 
 
315 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  76.32 
 
 
315 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  77.63 
 
 
329 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  66.77 
 
 
331 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.35 
 
 
331 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.89 
 
 
306 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.58 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  46.23 
 
 
341 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  48.07 
 
 
306 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  43.88 
 
 
301 aa  203  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  38.08 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  36.8 
 
 
304 aa  126  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 
296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  34.25 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  35.71 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  38.03 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  33.91 
 
 
249 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  33.91 
 
 
249 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  32.17 
 
 
313 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.29 
 
 
313 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  31.38 
 
 
284 aa  93.2  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 
311 aa  93.2  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  33.47 
 
 
302 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  34 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  33.71 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  29.47 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  33.66 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  32.64 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  32.73 
 
 
402 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  31.82 
 
 
309 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.01 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  32.1 
 
 
356 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  32.1 
 
 
356 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  31.69 
 
 
353 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  31.28 
 
 
356 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  31.28 
 
 
356 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  31.28 
 
 
356 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  31.28 
 
 
356 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>